Quando il software di vendita on-line ShopFactory invia i clienti alla gestione del pagamento, hai l'opzione di ottenere l'approvazione dei pagamenti on-line prima di ricevere un ordine.
Per consentire di accettare pagamenti degli ordini on-line, ShopFactory si integra con vari servizi di pagamento, come GlobeCharge, PayPal e Authorize.Net. È inoltre possibile combinare vari servizi di pagamento usando un account GlobeCharge.